这个话题说的人多，但大多数说得比较绝对，以我在重庆高校工作近二十年的经验，谈一谈自己的看法。

从综合实力看，排在第一位的肯定是重庆大学，是985和211高校，特别是和重庆建筑大学合并后，学科综合实力明显比较强。如果选择读理工科类的学科、建筑类学科，重庆大学在重庆是有绝对实力的。

重庆大学

其次是西南大学，西南大学是211大学，由西南师范大学和西南农业大学合并而成。因此其在师范和农业方向有很强的实力，当然，在计算机、电子和大量的文科专业方向也很强。

西南大学

重庆其它综合性的大学实力都不够强，但有一些在某些学科领域和行业比较强的学校。下面分别进行阐述：

陆军军医大学和重庆医科大学。这两所大学的医学方面实力都比较强，其中陆军军医大学原身为第三军医大学，是军队院校，重庆医科大学在西南地区都有很强的影响力。这两所大学在重庆都各有几所医院，在重庆和西南地区都比较有名。

重庆医科大学

西南政法大学。西南政法大学是西南地区专门从事政法类方向教育的高等学校，历史悠久，具有很强的专业实力。

西南政法大学

重庆交通大学。是原交通部直属院校，在道路、桥梁、港口等专业领域有很强的实力，毕业生遍布全国交通行业，有数量比较多的一批院士和高层领导本科毕业于重庆交通大学。因此，在交通领域，重庆交通大学在重庆是最强的。

重庆交通大学 科学城校区

四川美术学院。虽然名字是四川美术学院，但是却坐落在重庆大学城，老校区在黄角坪。四川美术学院出了一些大师级的人物，学校环境非常的有特色。应该说在西南地区都非常有名。

四川美术学院

重庆邮电大学 。在通信、计算机、电子等方向实力较强，坐落在南山上，环境优美，学校发展较快。

重庆邮电大学

重庆工商大学。是工商类高校，由原渝州大学和重庆商学院合并而成，在工商管理、财经等方面实力比较强。

重庆工商大学

重庆理工大学。前身为重庆工学院，一直在工业方向有较强的实力，近年来发展比较快。

重庆理工大学

综上所述，非要评出前5名还是有一定的难度，因为除了重大和西南大学之外，其他学校都是在各自领域有较深的积累，每个学校有每个学校的特色，在很多专业方向不具有可比性。