从学校层次来看两者差异不大，都是211院校和双一流学科院校。但是两者强势专业有所不同。

上海大学特色专业是电子信息科学与技术，化学工程与工艺，金属材料工程和美术学。苏州大学特色专业有汉语言文学、纺织工程、物理学、档案学、软件工程、放射医学、数学与应用数学。上海大学是理工科强校，而苏州大学是综合院校，专业门类比较多，医学专业也比较强。

上海大学

上海大学（Shanghai University），简称“上大”，是上海市属、国家“211工程”重点建设的综合性大学，教育部与上海市人民政府共建高校，世界一流学科建设高校，入选国家“111计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越新闻传播人才教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、教育部来华留学示范基地、上海市首批高水平地方高校建设试点、上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。

1922年10月，国共合作曾创建了上海大学，1927年被国民党当局强行关闭。1983年，上海市人民政府在复旦大学分校、上海外国语学院分院、华东师范大学仪表电子分校、上海科学技术大学分校、上海机械学院轻工分院、上海市美术学校的基础上成立上海大学。1994年5月，新的上海大学由上海工业大学（成立于1960年）、上海科学技术大学（成立于1958年）、原上海大学（成立于1983年）和上海科技高等专科学校（成立于1959年）合并组建而成。

学校拥有1个科技部与上海市共建的省部共建国家重点实验室，1个科技部与上海市共建的省部共建国家重点实验室培育基地，2个教育部重点实验室，1个教育部国际联合实验室， 2个创新引智基地入选“111计划”，2个教育部工程研究中心，1个国家体育总局体育社会科学重点研究基地，1个教育部批准备案建设的国别和区域研究中心，2个上海市协同创新中心， 8个上海市重点实验室，4个上海工程技术研究中心，3个上海市专业技术服务平台，1个上海市人民政府决策咨询研究基地，3个上海市社会科学创新研究基地，2个上海市高校E－研究院，1个上海高校智库建设项目，1个上海高校人文艺术创新工作室，2个上海高校人文社会科学研究基地，3个上海高校重点实验室，1个上海高校工程研究中心。

学校设有77个本科专业、42个一级学科硕士学位授权点、171个二级学科硕士学位授权点、15个硕士专业学位授权点（其中工程硕士含13个工程领域）；24个一级学科博士学位授权点、79个二级学科博士学位授权点、18个自主增设二级学科博士学位授权点（含7个交叉学科博士点）；19个博士后科研流动站。拥有4个国家重点学科、1个“双一流”建设学科、4个上海市Ⅲ类高峰学科、10个上海市Ⅰ类高原学科、7个上海市Ⅱ类高原学科，牵头建设2个上海市Ⅳ类高峰学科，7个学科进入ESI全球排名前1%。

一级学科博士点（20个）：数学、物理学、中国语言文学、中国史、世界史、管理科学与工程、信息与通信工程、 机械工程、 控制科学与工程、 材料科学与工程、 冶金工程、 环境科学与工程、 艺术学理论、 术学、 设计学、 新闻传播学、 戏剧与影视学、 社会学、 力学、 应用经济学。

博士后科研流动站（17个）：力学、电子科学与技术、冶金工程、数学、材料科学与工程、信号与通信工程、机械工程、控制科学与工程、社会学、中国语言文学、电气工程、新闻传播学、环境科学与工程、中国史、物理学、管理科学与工程和美术学

国家重点学科（4个）：钢铁冶金、机械电子工程、流体力学、社会学

上海市重中之重学科（1个）：钢铁冶金

上海市一流学科（11个）：社会学、世界史、数学、力学、机械工程、材料科学与工程、冶金工程、信息与通信工程、环境科学与工程、戏剧与影视学、美术学

上海市重点学科（第三期）（11个）：中国现当代文学、传播学、电影学、运筹学与控制论、无线电物理、固体力学、材料学、通信与信息系统、环境工程、美术创作中心、公共艺术创作中心

苏州大学

苏州大学（Soochow University），坐落于历史文化名城苏州，是教育部与江苏省人民政府共建的国家“世界一流学科建设高校”，国家“211工程”、“2011计划”首批入选高校，国家国防科技工业局与江苏省人民政府共建高校，江苏省属重点综合性大学，入选国家“111计划”、卓越法律人才教育培养计划、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、国家建设高水平大学公派研究生项目、国家大学生创新性实验计划、国家创新人才培养示范基地、海外高层次人才创新创业基地、新工科研究与实践项目、全国深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校等。

苏州大学前身是1900年创办的东吴大学，是中国最早以现代大学学科体系举办的大学，在中国最先开展法学（英美法）专业教育、最早开展研究生教育并授予硕士学位，也是中国第一家创办学报的大学。1952年院系调整，东吴大学的文理学院、苏南文化教育学院、江南大学的数理系合并组建苏南师范学院，同年更名为江苏师范学院。1982年，学校更复名苏州大学。其后，苏州蚕桑专科学校（1995年）、苏州丝绸工学院（1997年）和苏州医学院（2000年）等相继并入苏州大学。

学校有1个国家2011协同创新中心（牵头单位）；1个教育部人文社科重点研究基地；1个省部共建国家重点实验室，1个国家工程实验室，2个国家地方联合工程实验室，2个国家级国际合作联合研究中心，3个国家级公共服务平台，1个国家大学科技园，1个国家重点实验室培育基地，1个江苏省高校国家重点实验室培育建设点，4个江苏高校协同创新中心，19个省部级哲社重点研究基地，30个省部级重点实验室，11个省部级公共服务平台，4个省部级工程中心。

苏州大学共设有130个本科专业；50个一级学科硕士学位授权点，29个专业学位硕士点；28个一级学科博士学位授权点，1个专业学位博士点，29个博士后科研流动站；4个国家重点学科，1个省级重点学科，8个江苏高校优势学科，12个省级一级学科重点学科（含2个培育学科），5个江苏省重点序列学科，15个“十三五”江苏省一级学科重点学科。

一级学科博士点：哲学、应用经济学、法学、政治学、马克思主义理论、体育学、中国语言文学、外国语言文学、中国史、数学、物理学、化学、统计学、光学工程、材料科学与工程、化学工程与技术、计算机科学与技术、纺织科学与工程、软件工程、畜牧学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学、特种医学、护理学、设计学、工商管理

二级学科博士点（不含一级学科覆盖）：高等教育学、信号与信息处理

交叉学科博士点：生物医学电子信息工程、媒介与文化产业、新能源科学与工程、金融工程、医学系统生物学、激光制造工程、纳米材料与技术

世界一流学科建设学科

材料科学与工程（物质科学与工程）

国家级重点学科

纺织工程、内科学（血液病）、放射医学、外科学（骨外）

国防科工委重点学科

放射医学、内科学（血液病）

江苏省高校优势学科（二期）

政治学、绿色化学与化工过程、光学工程、材料科学与工程、纺织科学与工程、临床医学、特种医学、设计学

江苏省重点序列学科

法学、中国语言文学、数学、体育学、系统生物医学

“十二五”江苏省一级学科重点学科

哲学、应用经济、中国语言学、外国语言文学、中国史、数学、计算机科学与技术、教育学（培育点）、畜牧学（培育点）、统计学、软件工程、护理学